脚踝韧带出现损伤，3个月后还会感觉痛，主要是以下几种原因引起：

1、通常是治疗不彻底，导致功能恢复不好，如韧带拉伤损伤较严重，部分受伤韧带没有完全恢复正常结构，而患者急于下地、工作或进行锻炼，造成局部愈合不良。如果时间较久，可能导致彻底不愈合，而形成局部缺损或大量瘢痕组织，会造成局部疼痛；

2、如果拉伤或损伤后，经过医生的治疗，病变部位已经恢复正常，但没有积极进行功能康复训练，会导致局部肌肉韧带萎缩、粘连，踝部周边关节也会受累而出现僵硬，继而诱发疼痛。应及时定期复查，诊断具体情况后进行纠正治疗，通常经过有效治疗，4-6周后基本可以恢复正常；

3、如果韧带损伤部位发生感染，也可以造成局部出现炎症反应，而诱发疼痛；

4、如果长时间制动，或局部损伤后伴发血管损伤，血管形成血栓，其中静脉血栓最为常见，尤其在损伤部位形成血栓，也会诱发较严重的疼痛。