做试管婴儿所养成的胚胎进行胚胎移植，与自然怀孕时的胚胎形成正常的胚胎还是染色体异常的胚胎几率一样。试管的宝宝染色体也可能有问题，与自然怀孕一样，绝大多数试管婴儿的染色体均正常。做试管婴儿时，只是取出来女性的卵子和男性的精子，实验室用精子和卵子完成授精和胚胎的发育。等长到卵裂胚或囊胚的时候，选择评分好的优质的胚胎来进行胚胎的种植，所以并没有改变卵子和精子的染色体。
在怀孕的过程中，这一对夫妻可能会遇到的染色体问题，在做试管婴儿的时候也仍然会遇到。胚胎实验室观察不到胚胎的染色体是正常还是异常，只能通过外观的评分系统来进行评分，评分高的并不一定染色体正常。评分只能说明发育潜能尚可，但不能保证100%都是染色体正常的胚胎。
