头痛抑郁症应系统规范治疗，抑郁症可能会使躯体出现不适，如头痛、胸痛、后背痛等，患者痛觉感知较敏感，称为痛阈下降。目前认为头痛属于抑郁症的一部分，抑郁症治愈后，头痛自然会好转。目前抑郁的治疗包括药物治疗和非药物治疗，药物治疗即各种抗抑郁药，均具备调节痛阈作用，可有效缓解疼痛，如SSRI类药物，可改善抑郁症状，也可改善疼痛。
非药物治疗包括物理治疗与心理治疗，物理治疗常用电休克治疗，可以快速改善抑郁症发作。心理治疗是使用心理学技术与患者沟通，对于抑郁发生背景、不良情绪排遣方式、生活调剂等进行指导，对于改善抑郁症头痛具有较好效果。
