孩子矮小具体的原因主要包括先天性和后天性原因，具体如下：

1、内分泌性矮小，其中生长激素缺乏、甲状腺功能低下以及肾上腺皮质激素分泌过多，均是内分泌性矮小原因。性早熟可以引起骨龄超前，导致孩子最终身高矮小；

2、染色体异常包括特纳氏综合征，特纳综合征是女性矮小的染色体异常疾病，主要是由于女性两条X染色体，其中一条缺失或有基因问题存在而引起；

3、代谢性疾病，包括慢性疾病，哮喘、先天性心脏病以及慢性性功能不全孩子，可以引起矮小；

4、慢性营养性障碍性疾病，包括反复腹泻、乳糜泻等，以及尿崩症，均归类为代谢性障碍性疾病的矮小；

5、骨骼本身疾病引起孩子矮小，包括先天性软骨发育不全、骨成形不全；

6、宫内营养状况较差，即小于胎龄儿、家族性矮小，以及体质性青春期发育延迟，均属于先天性其它类别；

7、后天性原因与营养、生活环境以及压力、运动、睡眠相关。