肝囊肿是一种良性病变，不会癌变，治愈与否对身体没有太大影响。做B超检查时，B超医生检查后可发现在肝脏有1-2个小囊肿，直径为几毫米，手术切除的代价相对较大。先天性肝囊肿病人做CT后，CT上可见肝脏中布满大小不等的囊肿，最大的可达到10-20cm。巨大的肝囊肿可对病人的肝脏进行压迫，从而导致肝功能改变和异常，这种情况下可采取外科手术治疗。

外科手术的方法很简单，给囊肿开窗，在囊肿的顶上打一个小孔，囊肿中含有清亮的液体，抽干净囊液后，用电刀将囊肿壁烧灼，将囊肿壁细胞烧坏。先天性肝囊肿很多，有几十个甚至上百个，其余小的囊肿通常不进行特殊处理，所以完全治愈的可能性很小。