甲状腺炎在临床上有几种类型，其中急性、化脓性的甲状腺炎在临床上非常少见，是细菌感染所导致。另外一种是亚急性甲状腺炎，在临床上相对比较多见，亚急性甲状腺炎的病因不是太明确，有些研究表明可能与病毒感染有关，比如有些患者在感冒后或其它的病毒感染后，出现亚急性甲状腺炎。

在临床上最多见的叫做慢性甲状腺炎，比如桥本甲状腺炎，就是慢性淋巴细胞性的甲状腺炎，病因与体内的自身免疫反应有关，体内产生了针对甲状腺相关抗原的抗体导致的甲状腺功能破坏所引起，后期可以出现甲状腺功能减退等。