脊髓空洞症临床分为五个阶段，早期、中期和晚期，中期又分为中前期、中后期和中晚期。具体分析方法综合了空洞大小表现和病情等因素。一般早期诊断恢复目标较高，晚期患者病情较重，恢复缓慢而困难。

具体来讲，早期争取脊髓空洞消失或者无症状，达到临床治愈，中前期目标争取最大程度好转或者改善后再向治疗跃近，中后期目标先求稳定，再求改善。中晚期目标先使病情逐渐缓慢发展下来，再求稳定下来而进行好转。病情晚期仅能做到维持和支持。脊髓空洞症发病晚期，临床致残率非常高，重者可以出现呼吸功能障碍。