引起腰穿脑脊液白细胞升高的原因可以有脑炎，除此之外脑膜炎也可以导致腰穿脑脊液白细胞的升高。脑膜炎又可以分为病毒性脑膜炎、细菌性脑膜炎、真菌性脑膜炎等，不同致病菌导致的脑膜炎，白细胞升高的情况也不同。
病毒性脑膜炎导致的白细胞升高可能只是轻度升高，对于细菌性化脓性脑膜炎来说，脑脊液白细胞升高就比较明显。除了脑炎和脑膜炎，中枢神经系统的脱髓鞘疾病也可以有脑脊液白细胞的升高，如多发性硬化的患者腰穿后脑脊液的白细胞，也可以有轻度升高。
一些神经根的病变，如急性炎性脱髓鞘性周围神经根神经病，白细胞可以有正常或轻度的升高，但是脑脊液的蛋白升高得比较明显。
此外像脑膜癌病等中枢神经的肿瘤等，都可能会造成脑脊液白细胞升高，所以脑炎只是脑脊液白细胞升高的部分原因。除此之外，脑膜炎等疾病都可以造成脑脊液白细胞的升高。
