尿道口疼痛的原因有以下几种：
1、泌尿系感染：感染的时候尿道会有炎症刺激，比如白细胞或细菌引起的尿道刺激症状，引起的尿道口疼痛，疼痛一般还伴有肿胀，部分患者以尿道外口肿胀来看病的，此时患者可以完善尿常规检查，观察尿液中是否有白细胞，判断致病菌，然后进行针对性治疗。
2、非细菌性尿道口疼痛：主要是化验尿的时候没有白细胞，也没有细菌，提示仅仅是尿道口的肿胀，同时伴有疼痛，这时可诊断为非细菌性尿道炎。属于非感染性炎症，这种情况虽然没有感染，但也是炎症，常见病因有男性前列腺炎、精囊炎。
精囊液、前列腺液路过尿道的时候，因为本身有炎症，炎症会刺激尿道出现疼痛感。这种情况可以吃止痛的药物缓解症状，比如塞来昔布、芬必得等。
