甲状腺结节的性质可分为良性和恶性两大类。
其中以良性甲状腺结节以结节性甲状腺肿和甲状腺腺瘤居多，而恶性甲状腺结节则以分化型甲状腺癌居多。
良性结节大多较为安全，一般不需要手术切除，但如果结节是恶性的，也就是出现了癌变，就需要尽早通过手术的方式切除，病变晚期更是需要采取综合治疗来防止癌肿的远端转移。
甲状腺结节还可以分为实性与囊性。其中实性结节的内部是组织增生，是腺瘤和癌变的主要类型，而囊性结节的结节内部是液体，虽然很少会引起腺瘤或癌变的发生，但囊内出血的概率更高，容易造成患者出现局部疼痛。
第三种分类方式是根据结节对放射性核素的摄取能力不同，分为“热结节”和“冷结节”。“热结节”是指具有内分泌功能的自主性甲状腺结节，大部分是良性。而“冷结节”则是无内分泌功能的，有癌变的可能。另外如果结节内有出血或囊性病变，也可表现为“冷结节”。
