脑脊液镁偏低指脑脊液中的镁离子含量低于正常参考值，即＜1.2mmol/L。该数值偏低的原因主要为神经系统疾病，包括脑外伤、病毒性脑炎、原发性三叉神经痛、脑梗塞、偏头痛等多种颅脑损伤情况。
1.脑外伤：脑外伤后血液与脑脊液中Mg含量均出现下降，且下降程度与脑损伤程度呈正相关。
2.原发性三叉神经痛：脑脊液和血清中Mg含量下降。目前认为本病发作是由于三叉神经
3.脱髓鞘病变：可能与钙、磷、镁、铁、锌含量改变有关。
4.病毒性脑炎：在病毒性脑炎患者中，可表现出Mg水平降低的现象。而且镁离子会参与病毒性脑炎的病理生理过程。
5.脑膜炎：脑膜炎时患者脑脊液中镁离子可降低，这是神经细胞受损的一个危险指标。
6.脑梗塞：脑梗塞急性期可表现出脑脊液和血清Mg降低，以脑脊液改变更明显。
7.偏头痛：在偏头痛发作时，脑脊液镁浓度低于血清镁浓度。
