根尖瘘管需根据病因治疗，如果根尖瘘管多为牙源性，需做完善的根管治疗、冠部感染去除、根尖封闭。如果冠部已经做牙冠，或者纤维桩，无法从冠部打开，需从根尖搔刮。如果病变较大，单纯搔刮无法去除感染，需行根尖切除术，切开翻瓣进行彻底搔刮，再进行倒充填预备，根尖瘘管才能愈合。 根尖瘘管治疗为根管治疗，建议去除冠部，如果要是冠部无法去除，从根尖入路进行刮除、根尖切除或者根尖倒预备。根尖瘘管治疗均使用机械，所以口服消炎药仅为姑息治疗，无法完全去除病因，需到正规医院进行治疗。

根尖周病最彻底的治疗方法是根管治疗，90%的根尖周病可通过根管治疗方法治愈。一般无后遗症，但是如果前期不予治疗，可能会展成为骨坏死、根尖脓肿、瘘管、间隙感染，甚至坏死骨块形成脓肿。 根尖周病后遗症90%可治愈，只有10%因为进行正规治疗，所以会有并发症，并发症治疗较复杂，所以要行正规根管治疗。并发症不一定用药物治疗，可进行根管治疗或者根尖切除等手术治疗。

口腔内范围较小，任何手术都不可当做小手术。从专业方面讲，根尖囊肿手术除要做软组织切开、骨组织刮除、根尖去除，还要倒预备，相当于小骨科手术。不可将任何手术作为小手术，对待任何疾病都需要认真、耐心。 根尖囊肿手术，要遵循手术治疗原则，术前充分准备，手术中要注意周围重要组织、神经、血管，如颏神经、下颌神经、上颌窦。根尖囊肿手术，无需紧张，其创伤较小，与拔牙手术类似。

严重的牙周炎除菌斑控制、洁治、刮治、根面平整外，在稳定期可进行上翻瓣手术和正畸。重度牙周炎晚期牙齿会松动、咬合无力、牙齿变位，可在炎症控制住稳定情况下做正畸治疗。若牙齿已经松动可拔除后，再进行修复治疗，即镶假牙。 重度牙周炎可以配合全身药物治疗，如果由牙齿未及时治疗形成重度牙周炎，需要做系统的牙周规范化洁治、刮治、根面平整、翻瓣手术、正畸等。如果存在全身疾病，如高血压、糖尿病、免疫系统的疾病时，需配合全身用药。

根尖搔刮术是根尖切除术的步骤，如果口腔内有瘘管，无需做翻瓣，只需刮除根尖，刮除后存在一个软组织小创口。在这种情况下需防止感染，口腔内创口无法贴敷料，且口腔是特殊环境，可使用消炎漱口水，防止创口感染，或口服消炎药消炎止痛，防止创口裂开。饮食需进食半流食，避免进食辛辣、刺激食物，预防伤口感染，促进创口愈合。 如果根尖切除需进行翻瓣，刮除完后24-48小时内用冰敷，防止口内感染，可使用漱口水，还要嘱患者避免进食辛辣、刺激食物。

牙根尖炎90%均可以治愈，现在显微镜技术、超声、声波、激光、纤维技术可治愈根尖炎，不一定要拔除，可以保留牙齿，继续行使咀嚼和美观作用，根尖炎治疗方法为根管治疗。 如果根尖炎已经较严重，已经累及牙周，对牙骨质破坏较多，吸收也较多，牙松动达Ⅲ度，附着丧失较严重，此时需拔除，否则会影响全身。若为糖尿病、高血压、肾炎、肝炎患者，会引发远处感染、败血症、心内膜炎，所以无法治疗的情况下需拔除。

牙周膜息肉源于多根牙髓底，因为髓底穿通破坏发生牙周膜息肉。若髓底穿通则严重，无法将其留下，所以牙周膜息肉一般预后都较差。如果穿通较小，人为造成穿通而非感染造成，预后可能较好。 人为穿通一般无感染，可以MTA修补后再做完善根管治疗、冠部修复，这样牙齿可以保留。如果自行破坏，这种情况下髓底穿通较大，而后牙为多根牙，牙预后较差，需拔除。若未及时处理，可进一步发展为骨髓炎、牙根纵折、牙根折裂，甚至骨坏死。

根尖搔刮术如果仅在口内进行软组织刮除，口腔血运较丰富，抗感染能力较强，通常恢复约7-10天。但做根尖搔刮时因为骨组织上有炎症，肉芽组织才需要刮除，骨组织恢复一般约2-3年，根尖搔刮术有无恢复，需要在X光下才能观察到。 根尖搔刮术，如果只是软组织搔刮，恢复约7-10天，如果骨组织搔刮，恢复约2-3年，建议患者术后2个月、3个月、6个月、一年、两年时复查X光片，观察是否愈合，根尖组织有无封闭，根尖骨组织有无恢复，有无骨组织的形成，暗影有无变小。所以，恢复时间无法确定，恢复存在个体差异，如年轻人恢复较快，年龄大恢复较慢。