肝内胆管结石好发于肝左外侧叶和肝右后叶，这根据患者的解剖结构所决定。肝内胆管结石比较小，没有引起胆道梗阻的结石可以保守治疗，可以服用熊去氧胆酸片等，定期观察就可以。如果肝内胆管结石量比较大，引起胆道梗阻，这样需要积极的治疗，可以通过手术治疗来治愈。
肝内胆管结石的发病率近年来逐渐有下降的趋势，取而代之的是胆囊结石合并胆总管结石的发病率逐渐升高，主要是大家生活习惯的改变、饮食结构的变化所导致。