全国脑外科比较好的医院有北京天坛医院、复旦大学附属华山医院、四川大学华西医院等。 北京天坛医院神经外科已成为国内规模最大、亚专科最齐全的神经外科临床诊疗、教学和科学研究中心，是国家教育部重点学科，国家卫生部重点专科，教育部神经外科医师培训基地，国家卫生部继续教育基地。在国内率先建立具有国际先进水平的微创神经外科技术平台，降低患者手术后神经功能缺损，将神经外科手术从脑解剖结构保护提升到脑功能保护，推动我国神经外科学达到国际先进水准。 复旦大学附属华山医院神经外科是国内主要的神经外科中心，在我国神经外科史上写下了我国第一例脑肿瘤手术、第一例脑动脉瘤夹闭术、第一例脑干内生型血管母细胞瘤切除术、第一例自体干细胞脑内移植治疗开放性颅脑外伤等多个第一；迄今为止共施行了逾10万例脑外科手术，在神经外科的临床医疗、科研和教学等方面始终处于国内外先进水平。 四川大学华西医院神经外科是我国最早的神经外科专科病房之一，也是卫生部全国首批三大神经外科临床医生培训基地之一。复杂颅内血管病、颅底肿瘤、脑深部病变、功能神经外科、复杂颅颈交界区疾病等，成为了治疗的主体，超过手术病例的70％以上，诊治能力处于国内先进水平。