肠镜检查所需时间与医生技术水平、患者肠特性有关。部分患者的肠游离度大、肠相对较长而且部分弯角不同。

在患者肠弯角大、医生又拉不直的情况下，此时检查时间较长。通常水平高的医生在1-5分钟能进到底部。进去的时间越快越好，退出时间要＞6-8分钟，所以做肠镜最快需要8-10分钟。水平差的医生检查时间较长，如果患者肠特殊，时间会更长。