肠镜检查会有腹胀、腹痛的感受，但每个人对疼痛的忍受能力和敏感性不同，具体有多疼不能够界定。对于做过腹部手术、妇科手术或比较瘦的女性，疼痛感受较为明显，对于疼痛耐受性不好的病人，建议采取无痛肠镜检查。
若选择普通肠镜检查的病人担心疼痛，先应做好检查前的充分准备，尽量做好肠道准备，可以避免术中增加检查时间，减轻痛苦。另外术中如出现腹痛难以忍受，应及时告知检查医生，可以通过变换体位或调整充气量等措施，增加舒适度。最后应注意肠镜检查后观察有无腹痛、腹胀，若有轻微腹痛、腹胀，经过排气会有所缓解。若经过排气、排便后没有明显缓解或腹痛加剧，要警惕肠镜检查后并发症的出现，此时应及时到医院就诊。
