医学上认为肛瘘是肛周脓肿的后遗继发，肛周脓肿95%源于肛门腺感染，表现为突然出现肛门的轻微疼痛、坠胀不适、排便不尽感等症状。肛腺周围有丰富的淋巴组织和静脉，肛腺炎可经淋巴管向肛门周围扩散，才能形成肛周脓肿，出现局部的红、肿、热、痛，部分伴有低热情况。当然肛周脓肿破溃或切开后脓液流出，脓腔逐渐缩小，外部破溃口和切口也缩小，腔壁形成结缔组织增生，坚硬的管道壁结成瘘管，最后形成肛瘘。肛瘘和肛周脓肿主张早期治疗，感染的肛腺引起分支蔓延，病灶逐渐扩大，形成多个瘘管，超过两根的称之为复杂性肛瘘，瘘管向上蔓延，超高体积的称之为高位肛瘘，符合这两点的，即我们所说的高位复杂性肛瘘。生活中常见的引起肛瘘的原因有：

1、生活习惯：有长期的吸烟、喝酒、熬夜、久坐、不运动；

2、饮食偏好：喜欢吃辛辣油腻的饮食，对肛腺的刺激很大，容易引起肛腺发炎；

3、腹泻、便秘：腹泻时稀便容易滞留肛隐窝引起肛腺炎，便秘时干硬的大便会擦伤肛窦，引起肛腺炎；

4、原发疾病：像某些疾病引起肛瘘，如糖尿病、溃疡性结肠炎、克罗恩病、结核等等。