经皮肺穿刺活检通常在CT引导下进行，绝大部分的病人通过局麻，就可以达到麻醉效果。在CT引导下，确认肿瘤大小、形态，与周围组织、血管等的关系，评估安全性，明确穿刺范围，然后使用一次性的穿刺针，沿肿瘤的最大径与皮肤的投影处为进针点进针。
CT的引导下到达肿瘤中心部位进行取材，然后根据检测标本的需要多点取材、多次取材。因为除了需要做病理检测以外，还需要做免疫组化、基因检测，包括免疫治疗的相关一些检查。
随着穿刺针数增加，病人的不良反应也会相应增加，比如出血、感染、气胸等。要求穿刺完毕以后，病人回到病房要卧床休息超过24小时。有合并肺大疱，长期吸烟，肺气肿等合并症的病人，卧床时间要求更长，以避免术后出现气胸。
