腱鞘囊肿的治疗分为手术治疗和保守治疗两大块。保守治疗最主要的目的是通过机械性压迫，把囊壁击破，把囊液击出然后吸收，从而腱鞘囊肿就消失了。最常见的方法如果是手背上的腱鞘囊肿，可以用拇指按压，甚至用书背拍击，就可以把囊壁拍碎了。但如果病程时间过久，囊壁增厚特别明显，或囊和关节腔是相通的，此时腱鞘囊肿是非常难以把壁打破的。可能需要用穿刺抽液的方法来进行，把里面的液体放出之后，然后打入一定的药物，使囊壁互相粘连起来，从而治愈腱鞘囊肿。保守治疗虽然经济成本比较低，而且对于人体创伤相对比较小，但也有一个问题就是非常容易复发。因为通过各种各样的保守治疗，囊壁很难完全地切除，因此反复发作的这种潜在风险就会相对比较高。如果该部位的腱鞘囊肿反复发作，或已经发生了压迫周围血管神经的风险时，可能就要考虑关节镜治疗。关节镜微创治疗各种各样囊肿，具有切口小、恢复快等优势，是一个非常可靠的治疗方法。
