心脏球囊扩张术的优缺点，需要和其他的治疗方法对比才可得出。如与药物治疗对比，心脏球囊扩张术优点为可将狭窄部位扩开，而药物无法做到这点。而与支架植入相比，支架除可将血管扩开外，还可支撑起来，避免出现弹性回缩，但球囊扩张仅能起到扩开作用，后续可能会出现回缩，再次狭窄的几率较高，因此优缺点都是相对的。
目前多数患者都是先通过球囊扩张后，再植入支架，维持管腔通畅，达到充分解除冠状动脉狭窄的目的。当然心脏球囊扩张术与支架相比也有优点，为并不植入金属异物，但球囊较少单独使用。一般在小血管或在分叉病变血管处放支架时，并无过小的支架可使用，或放置主支支架后，容易压闭分支的情况下，可使用单纯的球囊扩张。
