桥本氏甲状腺炎目前无完全根治的方法。其病理特点为自身免疫系统紊乱，导致体内TGA和TPOA，即甲状腺球蛋白抗体与甲状腺过氧化物酶抗体显著增高，从而影响甲状腺素的合成。

因此，患者较容易出现甲状腺功能减退的症状，而目前针对降低此类抗体的治疗并无较好的特效药。对于桥本甲状腺炎患者，通常采用定期追踪和观察，以及检查甲状腺功能的方法进行检测。若出现甲状腺功能减退，则应该补充甲状腺素。若甲状腺功能正常，应定期观察。

少部分患者可能出现甲亢的表现，此时可以采用抗甲亢药物进行治疗。此外存在学者研究发现部分含硒的药物可以降低此类抗体，而药物效果因人而异，部分患者服用效果较好，部分患者服用效果并不理想。桥本甲状腺炎的患者是否服用含硒的药物，应听从医生的医嘱。