如果扁桃体肿大没有明显的疼痛和发热，一般是慢性扁桃体炎的表现。如果是单侧扁桃体极度肿大，要小心扁桃体肿瘤的可能性。必要时要考虑做扁桃体肿大的活检，做病理检查，以明确诊断排除肿瘤。
如果是双侧扁桃体肿大，一般常见的是慢性扁桃体炎的表现。如果慢性扁桃体炎没有任何不舒服症状，一般可以不治疗，观察即可，也没有不良影响。
但是慢性扁桃体炎常和胃酸、胃液反流刺激而造成的反流性咽喉炎有关，因为胃酸、胃液反流刺激扁桃体，时间长了就会导致慢性扁桃体炎持续加重，甚至出现各种不适症状，包括咽部的异物感、堵塞感，烧灼感等。要用抑制胃酸的药治疗，以减少胃酸、胃液反流对于扁桃体的刺激，慢性扁桃体炎才会逐渐缓解。
通常可以使用质子泵抑制剂，连续治疗至少4-8周。一般对于因胃酸胃液反流而造成的反流性食管炎、反流性咽喉炎，以及慢性扁桃体炎、扁桃体肿大，都可以取得较好的效果。
