卵巢囊肿的治疗需要结合具体的B超检查、患者的症状以及肿瘤标记物情况来判断，是手术、观察，还是药物治疗。卵巢囊肿比较多类型，常见的有以下几种：

1、直径5cm以下的囊肿：肿瘤标记物正常，没有其他症状的情况，可以观察，因为此时可能是生理性卵巢囊肿，经过2-3个月以后，可能就消失。如果是伴有痛经的巧克力囊肿，可以给予药物治疗或手术治疗。如果囊肿<4cm，比较小的可以口服短效避孕药，或者是注射GnRH类药物(促性腺激素释放激素)。超过4cm或者伴有不孕，患者则可以进行腹腔镜手术；

2、超过5cm的卵巢囊肿：如果囊肿持续存在，或者是体内有不规则的回声，有乳头、异常的血流信号，则需要进行手术治疗。根据肿瘤标记物和CT、核磁结果，如果是恶性可能需要开腹，进行比较彻底的手术，包括前子宫双附件，有时还要包括大网膜和淋巴结。如果考虑是良性，则可以进行腹腔镜的卵巢囊肿核除或者是一侧附件切除；

3、炎症性囊肿：如果是输卵管、卵巢共同形成的炎症性囊肿，首选可以用广谱抗生素抗炎治疗。经过积极治疗后，如果持续存在或者是没有明显缓解，也可以考虑手术治疗切除病灶。