高密度脂蛋白胆固醇偏低，意味着高密度脂蛋白胆固醇对于血管的动脉粥样硬化的保护作用会下降。因为高密度脂蛋白和高密度脂蛋白胆固醇是一种保护血管不发生动脉硬化，或者少发生动脉硬化的血脂成分，是一个好的血脂成分，对心脏血管和脑血管都有保护作用。
高密度脂蛋白偏低或者高密度脂蛋白胆固醇偏低，常见于老年人，年龄大了肝脏合成高密度脂蛋白胆固醇的能力就偏低，所以高密度脂蛋白会下降。
有些患者降得比较低，可以给予药物治疗，目前治疗高密度脂蛋白胆固醇低的药物还是传统的那几类，包括烟酸类药物、贝特类药物和他汀类药物。这三类药物是通常调整低密度脂蛋白胆固醇高，还有甘油三酯高常用的药物。
这些药物在治疗高甘油三酯血症和高胆固醇血症的同时，也能升高高密度脂蛋白胆固醇，大概升高10%。因此这些药物的抗动脉粥样硬化中的实现，一部分来自于它升高高密度脂蛋白胆固醇。
