夜间胃疼的原因可能是十二指肠溃疡、胃溃疡。此类患者的胃酸分泌总量不多，但夜间胃痛的症状主要由于患者黏膜屏障功能比较弱导致。

胃酸分泌有两个来源，夜间副交感神经兴奋可促进胃酸分泌，而胃腺体也可分泌胃酸，造成胃酸总量比较多。此外，胃食管反流的老年患者有夜间酸突破现象，此类患者可能会在夜间出现胃部不适，如反酸或疼痛。