胃肠道间质瘤病理学特点有以下几点：

1、间质性来源：不同于胃癌、肠癌，胃肠道间质瘤来自肠道的上皮或者黏膜，一般情况下是来自黏膜下固有肌层，所以看病理报告一般会报间质性来源，不会报黏膜来源；

2、形态表现不同：胃肠道间质瘤绝大部分是梭形细胞肿瘤，是梭形的，纺锤样，还有一部分是上皮型、混合型，这也不同于腺癌的表现；

3、关键性指标不同：关键性的指标比如会报核分裂象，核分裂象通俗来讲越高说明恶性程度越强。还有肿瘤异质性，比如肿瘤有没有玻璃样变、囊性变、坏死等；

4、免疫组化检测具有特征性：最重要的去评判是否是间质瘤，这时需要专业的病理医生去做免疫组化染色的检测。对于胃肠道间质瘤来讲，特征性的免疫组化检测，一般提示免疫蛋白的指标CD117，还有DOG1、CD34，通常情况下这些是阳性的。一般情况下CD117、DOG1阳性，结合形态学的表现，就可以明确诊断是胃肠道间质瘤。