临床目前还不清楚多动抽动综合症的病因，多数学者认为与遗传和环境因素有关系，具体情况如下：

1、遗传因素：多数多动抽动综合症患者有一定的家族史，比如家族中爸爸、妈妈、爷爷、奶奶、姥姥、姥爷或者三代之内的直系亲属，可能同时存在多动抽动综合症的症状；

2、妊娠期间存在高危因素：比如孕妇在妊娠期间吸烟、饮酒，或者孩子出生之后有高胆红素脑病等；

3、环境中铅暴露：如孩子长期生活在铅浓度过高的环境下或者经常喜欢玩含铅高的玩具，均可以导致体内铅的含量过高。由于铅属于重金属，会干扰人体中枢神经系统，出现行为异常；

4、大脑解剖异常：孩子大脑额叶对注意力以及行为力的控制能力下降，出现多动、抽动的情况。部分学者认为与大脑中枢神经系统中多巴胺分泌有一定的关系；

5、社会因素：例如孩子长期处于紧张、焦虑的环境或者家庭氛围比较紧张，如父母经常吵架、父母对孩子的要求过于严苛等，均可以导致多动抽动综合症。