胃间质瘤有时候会表现为一种胃上消化道不适的感觉，如腹胀、嗳气，部分有反酸、烧心等上消化道的表现，但是没有特异性表现。胃间质瘤的表现跟胃间质瘤大小有些关系，胃间质瘤的大小如2cm以内、2-5cm、5-10cm或者更大，临床表现也有区别。
1、肿瘤比较小：肿瘤＜2公分可能基本不影响胃功能。这时候可能是体检或者胃炎做胃镜发现，胃壁、胃黏膜下有隆起，经过检查可能高度怀疑是胃间质瘤；
2、肿瘤比较大：肿瘤进一步增大甚至到5cm以上，就会影响到胃功能，甚至吃食物后腹胀表现比较明显。
上述这症状也不是胃间质瘤的特异性临床表现，胃炎、严重胃炎、溃疡等都有可能。这时候做胃镜包括超声胃镜就可能帮助诊断，很有可能是胃间质瘤，手术后病理报告就可以确定。上述过程基本就是在临床上的诊断过程，如果有消化道包括上消化道不适的表现，要尽早到医院就医，尽快做胃镜早明确诊断，早治疗效果会比较好。
