患者输尿管上段结石合并肾积水，是因为结石在输尿管内形成梗阻，尿液引流不畅导致。患者可以根据结石大小、部位、质地以及并发问题选择合适的治疗方案，具体如下：

1、自然排石：适用于结石＜6mm，尿路无明显梗阻，结石表面光滑，如胱氨酸结石、尿酸结石。患者要多饮水，保证足够的尿量；

2、体外冲击波碎石：如果自然排石效果不好，可以考虑行体外碎石；

3、手术治疗：适用于结石较大的患者，可在内镜下碎石、取石，包括输尿管硬镜、输尿管软镜以及经皮肾镜；

4、并发症治疗：如果存在严重并发症，可以留置双节管或者肾造瘘引流尿液，症状缓解后行碎石、取石手术。