乙肝五项大三阳是指乙肝表面抗原、E抗原、核心抗体阳性，HPV-DNA的水平也比较高。这样的情况下是指乙肝病毒复制活跃、传染性比较强。而乙肝五项小三阳是指表面抗原、E抗体、核心抗体阳性，HPV-DNA阴性，就是HPV-DNA检测不到，病毒复制不活跃、传染性不强。这两种情况的比较，当然是大三阳比小三阳要严重。
但是小三阳也有特殊的情况，就是有20%-50%的小三阳的患者，发生了乙肝病毒前C区的变异，尽管病毒复制活跃，但是E抗原不表达，而表现为小三阳。这种情况下的小三阳HPV-DNA阳性，就是乙肝病毒复制活跃。所以这样的患者，传染性也比较强。而且这样的患者，就是发生了乙肝病毒前C区变异的患者，病情进展比较快，发生肝硬化和肝癌的几率比较高。这样的患者和大三阳比较起来更严重，所以小三阳HPV-DNA的阳性的患者，更需要积极地去干预，去抗病毒治疗。
