乙肝大三阳和小三阳的区别，主要在于乙肝5项中阳性化验不同，病毒复制量存在区别，传染性可能也有一定区别。大三阳是指乙肝5项中乙肝表面抗原、核心抗体、e抗原阳性，小三阳则是表面抗原、核心抗体、E抗体阳性，两者区别在于e抗原和E抗体阳性与否。
通常乙肝大三阳提示乙肝病毒属于活跃复制状态，如果通过血液检测乙肝病毒DNA水平，通常乙肝大三阳病毒复制量比乙肝小三阳更多。相应的乙肝大三阳传染性更强，对于肝脏破坏可能会更大。
所以对于病毒活跃复制合并有肝损伤患者，建议尽早通过抗病毒药物治疗。乙肝大三阳可通过抗病毒药物治疗一段时间后，转为乙肝小三阳和病毒低复制状态，但是并不代表乙肝小三阳没有问题。部分乙肝小三阳患者同时合并有肝功能异常，也需持续进行抗病毒药物治疗。
