一般治疗幽门螺杆菌是四联疗法，比如质子泵抑制剂，奥美拉唑等，加上铋制剂，比如枸橼酸果胶铋、胶体果胶铋、枸橼酸铋钾等，再加上两种抗生素来治疗幽门螺杆菌。
但是有些病人通常会出现抗菌素耐药，或者抗菌素不能耐受等情况，不能用四联疗法抗幽门螺杆菌，此时可以采取中草药，一般清热解毒、清热利湿的中草药可以抗幽门螺杆菌，比如荆花胃康胶囊里面的土荆芥，还有黄芩、黄连、黄柏、蒲公英，现在研究对幽门螺杆菌都有一定治疗作用。
在四联疗法，或者抗菌素无效的情况下，或者四联疗法治疗以后疗效不佳的情况下，可以加用中药来抗幽门螺杆菌，比如四联疗法再加荆花胃康胶囊，或者是把其中一个耐药的抗菌素换掉，比如克拉霉素耐药，可以换成荆花胃康胶囊，或者再加中草药，比如大黄黄连泻心汤，主要以黄芩、黄连、大黄为主，它能够清热、利湿、解毒、通腑泄热，对幽门螺杆菌也有一定作用。
