单侧肾脏萎缩是否算大病，与各个地方的医保政策相关，不能统一而论。单侧肾脏萎缩发生的原因，有后天性原因或者先天性原因。

先天性原因是胎儿在发育过程中，此侧肾脏出现异常发育，从而出现萎缩、丧失功能，对侧肾脏会出现代偿性增大，能够完全代偿，机体的代谢废物和生理功能。只要能正常长大、工作、生活，就是正常人，不需要特别关注。

如果后天性单侧肾脏萎缩，有可能是外伤或疾病造成。如果外伤造成，对侧肾脏有可能功能正常，在短的时间内可能代偿性增大，此时生理功能不受影响。

如果是疾病造成的单侧肾脏萎缩，由结核、炎症或其他疾病造成，对侧的肾脏同样有可能受到损害，即使不出现萎缩，也有可能功能受到严重影响，即出现血中肌酐升高的情况。

此时是否能办大病，需要到相应的医保部门去咨询或者申请。如果达到一定标准，就可以申请大病。如果达不到标准就不是，与医保政策以及实际情况相关。