通过临床试验，包括动物试验，小洞对肾脏功能没有任何影响，最关键影响是出血，因为肾脏血供占全身血供的20%以上，做完后最多的并发症是引起肾脏的出血。通过微创介入手术进行止血，所以做经皮肾镜对肾脏的功能不会有任何影响。
经皮肾镜是针对肾脏较大的结石或输尿管上端较大的结石所采取的微创手术。即在肾脏上打一个洞进去，一端在体外，一端在肾脏内，打洞以后用镜子，通过洞看到有结石进行碎石，碎石后把结石通过洞再吸出去。大概7mm左右，一般不超过1cm，所以洞非常小，经皮肾镜有时不止一个洞，可能会打2-3个洞，部分医院打5-6个洞。视结石的复杂情况不同进行处理，洞有小有大，大者可能7mm，小者可能3mm。
