鼓膜穿刺术有点痛，尤其有的患者对于耳部疼痛比较敏感，所以对于鼓膜穿刺术，通常建议适当使用一些麻醉剂来进行麻醉，如丁卡因或者可卡因。一般滴耳朵后使患耳朝上保持不动，滴药水后让药水在耳道里浸泡15分钟左右，必要时可以再滴、再麻醉一次。
这种情况下，虽然不一定能达到完全无痛的目的，但是一般可以明显减轻鼓膜穿刺疼痛。
另外，和医生的穿刺手法是否熟练有关，如果穿刺时只穿破鼓膜、不刺激鼓室内壁，可以明显减轻这种疼痛。但是如果穿刺针进入得稍微比较深，容易刺激到鼓室内壁，就容易导致明显的疼痛。所以穿刺时要尽量只穿破鼓膜，不刺激鼓室内壁，从而就可以明显缓解这种疼痛。
另外，穿刺后有必要的情况下可以做鼓膜置管，以防止鼓膜穿刺、穿孔马上闭合，而导致分泌性中耳炎再次复发，有可能需要再次穿刺。
