肺结核病的主要传染源是咳嗽咳出来的痰，里面可能混杂有结核细菌，即结核杆菌，其数量通常因人而异。有些有空洞型结核，以及没有治疗的结核，可能含有的结核细菌多一些。经过治疗之后，结核杆菌的数量会急剧减少。
咳出来痰要进行管控，养成良好的咳痰习惯，尤其是有结核疾病的病人，咳出来的痰最好是用纸包裹住烧掉，这是最彻底的办法，通过焚烧结核杆菌进行彻底消杀。也可以用一些消毒剂，在容器里边咳出来进行处理。
有时候咳嗽不一定能排出痰，咳出来是飞沫，其中也可能有结核杆菌。因为部分肺结核病人同时有支气管结核或咽喉结核，咳出来飞沫就可能含有结核杆菌，所以要注意局部空气的流通，开窗通风也非常重要。局部环境要进行有效的消毒处理，减少通过飞沫、痰液传染。
除了痰液和飞沫之外，极少数肺结核病人也可以通过消化道或体液进行传染，但相对比较少见。
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