肾囊肿手术需要住院多长时间，需要根据不同的情况进行判断，具体情况如下：

1、单纯性肾囊肿：也是指一个良性的囊肿，进行穿刺抽液处理，只需要住院观察2-3天即可；

2、复杂性肾囊肿：此情况可能存在恶性病变，此时住院的时间有可能需要5-7天或者更长的时间；

3、多囊肾囊肿：此时需要解除囊肿，可能会出现破裂出血或者感染的情况，其住院时间可能更加延长，可能需要半个月或者1个月的时间。部分病人发生多囊肾的囊肿的感染或者出血，很长时间得不到控制，可能需要住院1-3个月，最长的报道超过6个月，但是此情况极个别的情况，绝大多数半个月到1个月就可以出院。因为多囊肾的囊肿出现破裂出血或感染以后，主要的治疗方案是休息，应用药物进行治疗，而不是采用手术治疗。因为此情况下，如果将大的囊肿去除以后，小的囊肿就会出现空间变大、增长更快，从而出现更加严重的后果。

所以肾囊肿手术以后需要住院多长时间，每个病人不一样，而且各种手术都有可能产生不良的并发症。绝大多数人没有并发症，如果出现并发症，其住院时间就会相当的延长。