根管治疗包括机械预备和根管充填，通常不同阶段造成后续牙疼原因也不同。比如在机械预备过程中，如果病人出现疼痛，考虑机械性刺激。因部分病人根管存在狭窄和钙化，通过机械手段打通时可能会造成机械性损伤。另外，在根管扩大过程中，口腔材料对于口腔根尖产生化学性刺激，也可能会导致疼痛，此时建议通过口服药物或者调节牙高度来缓解疼痛。

此外，根管充填完成之后出现根管疼痛情况，可能是因充填材料对根尖部刺激，或者是材料长度超过根尖孔导致，可通过X光片能够解决。总之，若是机械性损伤，可以通过口服抗生素、调改过高牙尖解决。如果是超充导致，建议取出牙胶尖进行再一次根管处理。