肛周脓肿的治疗方法包括药物治疗、手术治疗等。

一、药物治疗

1、口服抗生素：对脓肿引流后感染控制不好的患者，应根据细菌培养结果调整抗生素。 对于身体状况良好的非复杂性肛周脓肿在行脓肿切开引流术后不推荐常规使用抗生素治疗。对于伴会阴部坏死性筋膜炎的患者，在积极手术清创的同时，必须联用高效广谱的抗生素。

2、外用抗感染药膏：主要在脓肿未形成或未切开引流时使用，当脓肿切开引流后，无需继续使用。

3、泻药：有排便困难的可以口服缓泻剂来软化大便，减轻排便时的疼痛症状。

二、手术治疗

肛周脓肿一经确诊，应尽快行脓肿切开引流术，以免感染进一步扩散。根据脓肿的深浅和具体的位置，其采用的麻醉方式和手术操作步骤有所区别。

1、肛周皮下脓肿及部分位置表浅的坐骨直肠窝脓肿：可以在局麻下完成，切开脓肿后给予凡士林纱布填塞，起到引流和局部止血的作用；位置较深的脓肿需全麻下切开，需置入引流管进行引流。

2、直肠黏膜下脓肿及括约肌间脓肿：需在肛门镜的辅助下行脓肿切开引流。

3、坐骨直肠窝脓肿与肛提肌脓肿合并时：需要对肛提肌充分扩创，经坐骨直肠窝引流，辅以引流管引流。

大部分肛周脓肿在切开引流之后可以痊愈，约有44%-50%的患者会出现脓肿的复发，且大多发生在初始治疗后1年内，需要再次行手术治疗。