甲硝唑在妇科疾病中应用范围比较广泛，对于妇科炎症主要是针对阴道炎进行治疗，细菌性阴道病以及滴虫性阴道炎都可以选择甲硝唑进行治疗。对于细菌性阴道病，甲硝唑是一种比较理想的治疗药物，可以抑制厌氧菌生长而不影响乳酸杆菌的生长。
甲硝唑可以口服，也可以选择局部用药，两种治疗方法都可以起到一定的作用，治愈率均在80%左右，一般疗程为一周左右。而对于滴虫性阴道炎，一般是选择甲硝唑进行全身、单次、大剂量使用，同时性伴侣要接受治疗。另外，由于甲硝唑在治疗滴虫性阴道炎时，需要单次口服大剂量的甲硝唑，容易出现胃肠道反应，比如恶心、呕吐等，还可能出现皮疹等，一旦停药，这种症状就会消失。治疗期间以及停药24小时内严禁饮酒，因为甲硝唑容易与乙醇结合，进而出现皮肤潮红、呕吐、腹痛、腹泻等戒酒硫样反应。
甲硝唑能通过乳汁排泄，所以在哺乳期用药时，一般在用药期间以及用药后24小时内不宜哺乳。对于甲硝唑在妇科炎性疾病中的治疗，盆腔炎症的疾病用甲硝唑的范围也比较广泛，可以与头孢类的抗生素、喹诺酮类的抗生素联合使用，用于治疗由于厌氧菌感染或者革兰氏阴性菌感染等引起的妇科炎症，作为一种广谱抗生素，甲硝唑在妇科疾病中的应用非常广泛。
