胆管反流可以出现恶心、发烧的情况，严重情况下可能引起胆管炎，尤其部分胆管下端开口较大时，吃的食物可以反流到胆管，经常出现持续低烧情况通常为反流性胆管炎的常见症状。此时需经常服用利胆药物，促进胆汁排泄，同时饮食应保持规律，如果经常进食过量，更容易造成胆管反流。对于特别严重的情况，甚至还需要进行胆道的改道手术。
胆管在正常情况下，通常不会发生反流，即胆管下端开头的地方有Oddi括约肌，通常呈收缩状态，食物或胃肠液不会反流到胆管。如果因部分疾病造成胆管下端开口不能正常收缩，不能阻止肠液往胆管反向的流动，会造成胆管的反流，即胃液、肠液反流进入胆管。现在随做内镜、ERCP，将胆总囊管下端切开进行治疗，或者取石、放支架等，也可以造成胆管下端的开口功能受到影响，容易发生胃肠液反流到胆管的情况。
