无论是四联还是三联的幽门螺杆菌治疗，在没有幽门螺杆菌感染的情况下，均不建议预防性的进行杀灭幽门螺杆菌的治疗。幽门螺杆菌的治疗方案，以前在亚洲区以外使用三联治疗，随着三联的使用，耐药性增加，亚洲区还是使用四联治疗。四联中有两种抗生素，使用的剂量和疗程均相对较大。因此在使用抗生素的时候，会产生一定的副作用，相较于对抗，比如常用呼吸道、泌尿系，或消化道细菌感染的时候，使用抗生素的剂量要大，因此抗生素产生的副反应便会相对大，而且抗生素的使用、配伍有明确规定，而不是随便几种抗生素均可以随便配，出现相互作用的机会会较高，配伍禁忌，以及副反应的发生几率便会增加。因此在没有幽门螺杆菌感染的时候，不建议进行杀灭幽门螺杆菌的治疗。

在杀幽门螺杆菌的时候，同时要用到质子泵抑制剂，本身质子泵抑制剂的使用，便有可能增加萎缩性胃炎的发生，以及胃息肉的发生，因此在没有适应证的情况下，也不建议进行预防性的幽门螺杆菌四联治疗。另外金属铋剂的黏膜保护剂，即用在四联里的药物，本身便具有轻微的杀灭幽门螺杆菌的作用，同时认为带金属铋剂的黏膜保护剂，目前在国外、国内消化专业，不推荐作为黏膜保护剂使用，而是只作为杀幽门螺杆菌的治疗。