原发性肝癌最常见的转移途径是肝内转移。原发性肝癌容易在肝内形成播散，在较大的肝癌病灶周围可以形成卫星灶，或者借助于肝内的血管分支而出现肝内的播散。
原发性肝癌还可以直接侵犯肝脏的门静脉系统，逐渐形成门静脉分支癌栓、门静脉左支或右支癌栓，甚至是门静脉主干癌栓。肝癌还可以侵犯肝静脉系统，形成肝静脉及下腔静脉癌栓。
肝癌在手术切除之后，最常见的复发部位也是在肝内，也有可能出现肝周淋巴结的转移以及肝外转移。比较常见的肝外转移部位，包括肺转移、骨转移、脑转移等。
较大的肝癌，或者肝癌自发破裂出血，肿瘤细胞会在腹腔内形成种植性转移病灶。在腹腔内，可以发现肿瘤包块或者合并有癌性腹水等。
