胚胎不好有好多原因造成，本身胚胎不好也是一个模糊的说法。胚胎不好主要是形态学上和遗传学上有不好的方面。具体原因如下：
1、胚胎不好有可能是因为发育速度过快和过慢，可能在卵裂球分裂的过程中，基因组装配速度不适合，造成基因组容易出问题。所以胚胎发育太快或者太慢，造成胚胎不好；
2、胚胎在发育过程中形成的大量碎片和大小不均，多被认为是胚胎不合体外生存环境做出的反应，还有促排方案，合子有丝分裂异常。将功能的缺陷和精子DNA碎片都会影响到胚胎质量，从而诱发碎片形成，也会大大降低胚胎移植妊娠率，从而造成胚胎不好；
3、由于胚胎在形成过程中形成的非整倍体胚胎，主要是由于卵子在减速分裂过程中出错造成，这样的胚胎没有妊娠潜力；
4、胚胎出现单基因或者多基因错配，造成基因功能丧失，这样产生的胎儿是有问题的，多数会有单基因疾病或者多基因疾病；
5、由于促排卵，获得的卵子的DNA本身存在问题，大量的研究表明，促排卵获得的卵子中大约有40%的卵子本身染色体就存在问题。
