有时增强CT可有效发现肿瘤，但病理诊断才是肿瘤诊断的金标准。所以通过影像学增强CT的检查，以及病理诊断，才可最终对癌症做出更确切的诊断依据。故癌症筛查时，通过影像学检查，如增强CT，可发现部分癌症，但并非绝对，如部分实质性器官，包括肺部、肝脏、胆道、胰腺等癌症，通过CT检查有助于鉴别。
而部分器官对CT的敏感性相对差，如部分浅表腺体，包括甲状腺、乳腺，这时借助彩超检查即可发现可疑病变。对于空腔脏器的检查，CT检查受到一定局限性，如食道癌、胃癌、肠癌，这类空腔脏器检查，尤其非常早期的病变，需借助于镜检，如食道镜、胃镜、肠镜的检查，更有助于发现黏膜早期的病变。这类情况通过增强CT有时难以鉴别，但CT可对病变局部所侵袭的深度，以及周围淋巴结或者周围器官的毗邻情况，进行初步判断，最终诊断需依据于穿刺活检或术后病理。
