总体而言，食道间质瘤发生率并不低，而且间质瘤分很多种，大部分是良性，还有些是恶性间质瘤。如果发现食道间质瘤，可能做胃镜、超声内镜等检查，还可以做胸部增强CT，观察间质瘤的大小、范围，有无周围侵犯，形态学是符合良性，还是恶性。最准确的检查是在食道间质瘤上取活检，观察细胞学行为。
如果诊断是良性间质瘤，而且又不大，较小的情况下，比如几毫米，或者1cm、2cm，而且生物学行为又比较惰性，不太生长，观察即可。如果是恶性间质瘤，生长又比较快，建议综合治疗的情况下能进行手术就手术，如果不能手术，有靶向药物或加上局部放疗还是能够控制住的。所以一旦提到间质瘤时，大部分都是良性的概念，但具体要靠病理判断到底是不好的还是好的。
