颅内肿瘤手术风险高低主要与肿瘤所在部位、比例、结构、肿瘤周围血管神经有关，越表浅、非功能区手术风险较低。另外，手术涉及到是否美观，因外科是一种医学艺术，通常采用手术治疗还需考虑整体美观效果。临床常采用微创治疗手段，如经颅底治疗、经蝶治疗、经鼻腔手术等，如果在鞍区进行经蝶手术，对于患者而言头部没有手术切口，只经过鼻腔即可将肿瘤切除，创伤相对较小。
此外，手术风险系数大小与医疗机构水准、手术部位、术中CT、核磁有关，医疗机构有实力，术中导航确保手术部位精准，均会降低手术风险。正规且专业的医疗机构，医生资质及技术成熟，手术风险比其他医疗机构低。此外，颅内肿瘤本身即有一定风险，需通过医疗机构、医生、家属及社会全体人士共同努力，将患者手术风险降至最低。
