孕妇治疗幽门螺杆菌的方法取决于孕期的长短，以及幽门螺杆菌的严重程度，常见如下：
1、如果孕妇感染幽门螺杆菌后无明显的症状，可以在生产后再进行幽门螺杆菌的治疗；
2、如果患者感染幽门螺杆菌后有上腹疼、胃疼、恶心、呕吐、反酸、烧心等症状，影响平时的生活质量，在孕早期可以用对症药物，例如咀嚼铝碳酸镁，既安全又能缓解患者的症状。如果在中晚期的情况下，也可以加用益生菌类药物进行治疗和抑制幽门螺杆菌；
3、如果患者感染幽门螺杆菌比较严重，例如患有溃疡病合并消化道出血，有早期胃癌甚至是进展期的胃癌、有消化系统以外的疾病，如原发性血小板减少性紫癜、严重的缺铁性贫血或MALT淋巴瘤等。此时要权衡利弊，在一定的情况下需要进行根除幽门螺杆菌的治疗，同时要对胎儿的发育进行实时的监测。
