肾盂癌手术以后，生存时间超过5年的概率大约为80%，但只是一般的推算，具体要看患者手术时的年龄、合并症以及术后有无转移和扩散、复发。肾盂癌的患者需要切除一侧肾脏，患者会担心另一侧肾脏是否能够补偿输尿管和膀胱相连的部位。如果对侧肾脏功能术前较好，对全身肾脏功能影响不大，不会对患者的生存有不好的影响。
肾盂癌属于移行上皮癌，即使把一侧肾脏输尿管切掉，对侧的肾脏、输尿管、膀胱部位，都可能有肿瘤的复发。肾盂癌术后参照膀胱癌的处理原则，需要进行膀胱的灌注化疗，定期复查膀胱镜。如果一直存在复发，在一定程度上会降低患者生存寿命。而如果肾盂癌出现局部复发、远处转移，则需要按照移行上皮癌进行全身系统化疗，患者的预后会变差。
