乙肝相关性肾炎的鉴别诊断，根据病理类型、临床表现和其他肾炎进行鉴别。乙肝相关性肾炎，有乙肝相关的膜性肾病以及乙肝相关的系膜毛细血管样肾病，这两种病理类型为多，主要和其他继发性肾炎鉴别。

狼疮性肾炎，首先患者是狼疮，狼疮11条符合4条就可以诊断狼疮，患者有狼疮性肾炎的表现，比如尿液化验异常，有蛋白尿、血尿、管型尿，还有肾功能异常，比如尿素氮、肌酐升高，都是狼疮性肾炎的表现。化验血有抗核抗体阳性，双链DNA阳性，史密斯抗体阳性，是狼疮的诊断，可以通过这些诊断狼疮性肾炎。还可以做肾活检，狼疮肾活检可以看到狼疮特殊的病理表现，也能辅助诊断狼疮性肾炎。狼疮和乙肝肾的鉴别是比较容易的，通过抽血化验就能做到鉴别。

其他的继发性肾炎，ANCA相关性血管炎的肾损害，也可以和乙肝相关性肾炎鉴别。ANCA相关性血管炎是多系统病变，可以看到其他系统的表现，比如消化道、肺、结膜等全身血管炎多处损害，血里面可以查到ANCA阳性等辅助鉴别。过敏性紫癜肾炎、妊娠肾炎也可以和乙肝相关肾炎鉴别，过敏性紫癜肾炎往往前面有过敏性紫癜的病史，皮肤紫癜、关节痛、腹痛的病史能辅助进行鉴别。